Deze zakjeszwam vormt knotsvormige vruchtlichamen die alleen of met een paar tegelijk, ontspringen uit de ondergrondse gastheer. De top is bol- of eivormig verdikt, 1-2 cm breed, duidelijk afgescheiden van de steel, rood- tot zwartbruin, fijn gepuncteerd. Steel cilindrisch, verdikt naar de voet, 4-9 x 0.5-1 cm, helder geel, later olijfbruin en uiteindelijk zwart, vezelig-schubbig. Vlees geel, zonder opvallende geur of smaak. Het uiterlijk van de Ronde truffelknotszwam is heel karakteristiek en kan niet verward worden met een andere soort. Microscopisch zijn echter twee soorten verscholen onder dit uiterlijk: de Grootsporige truffelknotszwam (E. longisegmentis) heeft sporen van 40-65 μm lang, de Ronde truffelknotszwam (E. capitata sensu stricto) sporen van 7-30 μm lengte.